從預防角度看，去除牙菌斑是口腔衛生的重點。因為牙菌斑是齲病和牙周疾病崐兩者的共同因素之一，如果清除了牙菌斑，也就解決了齲病和牙周疾病的預防問題崐；同時也使牙結石失去了賴以形成的基礎。
檢查刷牙效果的標准，就是看牙菌斑是否已經完全清除淨。在牙面附著的牙菌斑較薄，顏色與牙齒相似，肉眼一般不易看見牙菌斑，常用牙菌斑顯示劑進行染色，表示牙菌斑存在的部位和數量。這樣既可用來作為評價個人口腔衛生的客觀數量。這樣可用來指導個人進行重點清潔。
菌斑染色劑酚片劑和溶液兩種。片劑的應用，先將藥片放入口內，嚼碎並與唾液充分混勻，用舌頭塗布於牙面，然後用清水漱口即可顯示出有色的牙菌斑；若用2％藻紅液染色，先用棉球將藻紅液塗在牙面上，或者直接滴少量藻紅液於口腔內，或稀釋含漱染色，也可取得同樣的效果。
一般情況下，染色後，自己可用鏡子對照口腔檢查，凡是有染色的牙面，就說明這些染色牙齒還沒有刷干淨，需重新再刷。當後牙的頰側自己通過鏡子看不清時，可請別人幫助檢查，指出自己還有哪些部位沒有刷干淨。這樣，經過多次反復檢查，自己也可總結經驗，摸出規律，哪些部位經常不易干淨，就可指導自己今後加強某些部位的刷牙。最近還有一種新型溶液顯示劑，經塗擦漱口後，能辨別出是剛形面的初期牙菌斑，或是成熟的牙菌斑，前者顯紅色，後者則顯藍色。
