牙周組織的防御機制包括：
1.皮屏障
（1）龈牙結合部的牙龈組織借結合上皮與牙齒表面連接，稱為上皮附著，封閉軟硬組織的交界處。結合上皮的更新約為5天，比牙龈表面上二皮的更新約快1倍。表層的衰老細胞以較快的速率脫落到龈溝內，同時使附著於結合上皮的細菌也隨之脫落，這是龈牙結合部的重要防御機制之一。
（2）結合上皮在抗菌防御中不僅具有上皮屏障的作用，而且結合上皮細胞本身能產生有效的抗菌物質，包括防御素和溶酶體酶。被微生物產物激活的上皮細胞能分泌趨化因子如白細胞介素，細胞因子如白細胞介素-1和白細胞介素-6，及腫瘤壞死因子α，它們吸引並激活專門的防御細胞如淋巴細胞和中性粒細胞。
2.噬細胞
（1）中性粒細胞
1）龈溝內的中性粒細胞是抗牙周致病菌的第一道防線。有證據表明，某些伴有PMN數目減少或功能缺陷的全身疾病，如周期性白細胞缺乏症、Chediak-Higashi綜合征、掌跖角化-牙周破壞綜合征等患者常伴有嚴重的牙周炎。
2）PMN在牙周炎症過程中還具有致炎的雙重作用。如果PMN對病原刺激物的反應過於激烈，便會對機體產生免疫損傷。其產生和釋放的致炎細胞因子也會加重炎症。PMN在炎症過程中還具有調節作用，通過合成和釋放具有免疫調節作用的細胞因子而參與免疫應答的誘導。
（2）單核／巨噬細胞：是宿主防御系統的重要組成部分，在動員宿主的防御機制抗細菌感染中發揮關鍵作用，維持著宿主-微生物之間的平鷹。
3.溝液
指通過龈溝內上皮和結合上皮從牙龈結締組織滲入到龈溝內的液體。龈溝液的液體成分主要來源於血清，其他成分則分別來自血清、鄰近的牙周組織（上皮、結締組織）及細菌。內容包括補體-抗體系統成分、各種電解質、蛋白質、葡萄糖、酶等，也含有白細胞（主要為通過龈溝上皮遷移而出的中性粒細胞）、脫落的上皮細胞等。
龈溝液具有以下作用：①通過GCF流沖洗龈溝內的外來物質；龈溝液這種清洗龈溝的作用足局部防御機制的一種重要方式。②含有可以促進上皮附著於牙面的血漿蛋白。③具有抗微生物的特異性抗體。④在牙龈防御機制中，醫.教育網搜集其所含補體可促進抗體的活化。⑤龈溝液中的白細胞是重要的防御細胞。⑥龈溝液中含有多種酶，其中天冬氨酸轉氨酶、鹼性磷酸酶、膠原酶等與牙周病的嚴重程度和活動期等有一定的關系，同時龈溝液中還含有酶抑制物，能抑制PMN產生的多種中性蛋白酶等。⑦能提供龈下細菌豐富的營養成分，⑧提供牙石礦化的物質。⑨從全身途徑進入體內的某些藥物如抗生素等，也可進入龈溝液，並達到高而持久的濃度，因而可被利用來進行牙周治療。
4．唾液
具有潤滑、緩沖、清潔、抗微生物、凝集、薄膜形成、消化等多種功能，是宿主口腔免疫防御系統的重要組成部分之一。唾液的保護作用與其有效成分、流量、流速有密切聯系，唾液功能失調會導致嚴重的口腔軟硬組織疾患。
（1）唾液的物理特性可以起到生理性保護作用。有效的唾液流量／流速可以提供必要的潤滑作用，幫助運送食物、清除細菌和脫落的上皮以及不斷補充新鮮的抗菌成分，如溶菌酶及免疫球蛋白等。唾液的緩沖作用對保持牙釉質的動態平衡是非常關鍵的。
（2）唾液蛋白參與牙菌斑的初始形成、菌斑的礦化和牙石的形成。
（3）唾液中還含有豐富的抗微生物成分：如溶菌酶、過氧化物酶、乳鐵蛋白、分泌型免疫球蛋白A（SIgA）等，並存在抗牙周致病菌的特異性抗體。
（4）唾液中的其他蛋白質，如富脯蛋白等可能對口腔細菌的生態環境有影響。
（5）唾液中的細胞成分除脫落的上皮細胞外，還含有主要來自龈溝液的各種自細胞，主要是中性粒細胞。
綜上所述，上皮附著的封閉作用、結合上皮細胞的快速更新和修復能力，唾液的沖洗、凝集素和IgA的保護作用，龈溝液的沖洗、調理和IgG；補體的免疫作用，以及中性粒細胞和單核／巨噬細胞的吞噬和殺菌作用等，構成了牙周組織的多重防御機制。此防御機制對於抵抗牙菌斑向龈溝延伸、保護牙周組織免受細菌入侵和破壞起了極其重要的作用。
