牙周疾病是細菌所致，這已為許多科學研究所證實。但口腔內絕大多數細菌是固有的，不像結核病那樣的致病菌(結核桿菌)是由外界感染而來的。 口腔內固有的細菌，在一定的條件下，當食物殘渣堆積、牙列擁擠、刷牙方法不正確等，形成牙菌斑、牙石，當細菌的種類發生變化、致病菌的量增多或身體抵抗力下降時導致牙周病的發生。 牙周疾病也不像結核病那樣能找出一個確定的致病菌，它是由多種細菌協同作用引起的。
