1、細菌
在齲齒的發生和發展過程中，細菌在齲病發病中起著主導作用，致齲的細菌種類很多，近年來國際口腔學界公認其中最主要的致齲病菌是變形鏈球菌和乳酸桿菌。這些細菌容易與唾液中的粘蛋白和食物殘屑混合在一起，並牢固地粘附在牙齒表面和窩溝中，這種粘合物就叫作牙菌斑或菌斑（dentalplaque）。菌斑中的大量細菌產酸，會造成菌斑下面的牙齒釉質表面脫鈣、溶解，臨床調查證明，口腔中菌斑較多的兒童，齲齒也多，有直接因果關系。
2、飲食
在齲齒形成過程中，飲食是細菌滋生的重要作用中介。由於多數食物中含有大量的碳水化合物和糖，這些物質成為供給菌斑中細菌生存和繁殖的能量，同時通過細菌的代謝作用使口腔中的糖酵解，產生大量有機酸，這種有機酸如果長期滯留在牙齒表面和窩溝中，致使釉質脫礦遭到破壞，失去釉質保護的牙表面，被某些細菌促使蛋白質溶解，進而形成齲洞。可致齲的糖類很多，研究發現最主要的威脅來自蔗糖。
牙齒發育時期，營養決定牙齒組織的生化結構，鈣化良好的牙齒抗齲性高。如果食物中含有的礦物鹽類、主要維生素和微量元素，如鈣、磷、維生素B1、D和氟等不足，牙齒的抗齲性就低，造成齲齒發病的條件。乳牙在胎兒期即已發生、發育和鈣化，母新乳期的營養，對胎兒乳牙的發育雖然沒有決定性影響，但加強母體營養仍對乳牙鈣化有利的。除非母體患嚴重代謝障礙病或遺傳病，一般乳牙不易受到嚴重影響。
3、牙和唾液
牙齒的形態、結構和位置也與齲齒發病有著明顯的關系。
牙齒咬面的窩溝，是兒童牙齒發育過程中不可避免的生理缺陷，較深窩溝內容易滯留細菌和食物殘屑，而且不易清除掉，從而容易誘發齲齒；另一方面，牙齒發育階段如果礦化不足，特別是由於鈣化不足的牙齒，釉質及牙本質的致密度不高，會導致抗齲性低，較容易患齲齒；氟在牙齒礦化結構中的含量雖然很微少，但根據研究發現對增強牙齒的抗齲性也很重要，牙齒發育過程中如果能令牙齒自然吸收含有適量的氟，較不易發生齲齒。由於乳牙和年輕恆牙的結構和鈣化程度均不夠成熟，通常很容易受致齲因素的影響，因而患齲率高。
唾液是牙齒的直接外部環境，直接起著緩沖、洗滌、抗菌或抑菌等重要作用。唾液分泌的性質和成分，不僅影響牙齒咀嚼時的緩沖作用，最重要的同時也影響口腔有害細菌的生活條件。因此，作為影響齲齒形成的唯一可變因素，從如何改善唾液分泌入手，成為了防治齲齒的關鍵及唯一途徑。
