復發性口腔潰瘍是比較復雜的一類口腔潰瘍，復發性口腔潰瘍的治療也是比較復雜的，一般分為局部治療和全身治療。
(一)局部治療口腔潰瘍主要目的是消炎、止痛，促進潰瘍愈合。
治療方法較多，根據病情選用：
1、含漱劑0.25%金霉素溶液，1∶5000氯已定洗必泰溶液，1∶5000高錳酸鉀溶液，1∶5000呋喃西林溶液等。
2、含片杜米芬含片，溶菌酶含片，氯已定含片。
3、散劑冰硼散，錫類散，青黛散，養陰生肌散，黃連散等是中醫傳統治療口腔潰瘍的主要藥。此外，復方倍他米松撒布亦有消炎、止痛、促進潰瘍愈合作用。
4、藥膜其基質中含有抗生素及可的松等藥物。用時先將潰瘍處擦干，剪下與病變面積大小相近的藥膜，貼於潰瘍上，有減輕疼痛，保護潰瘍面，促進愈合的作用。
5、止痛劑有0.5%～1%普魯卡因液，0.5%～1%達克羅寧液，0.5%～1%地卡因液，用時塗於潰瘍面上，連續2次，用於進食前暫時止痛。
6、局部封閉適用於腺周口瘡。以2.5%醋酸潑尼龍混懸液0.5～1ml加入1%普魯卡因液1ml注射於潰瘍下部組織內，每周1～2次，共用2～4次。有加速潰瘍愈合作用。
7、激光治療用氦氖激光照射，可使粘膜再生過程活躍，炎症反應下降，促進愈合。治療時，照射時間為30秒～5分鐘。一次照射不宜多於5個病損。
(二)全身治療因病因尚不清楚，治療效果不夠理想。
1、免疫抑制劑目前認為本病與自身免疫性疾病有關，近年來試用免疫抑制劑治療，部分病例有一定效果。若能經檢查確定為自身免疫性疾病，采用免疫抑制劑則有明顯療效。常用藥物為腎上腺皮質激素：潑尼松(強的松)5mg/片，地塞米松0.75mg/片，一日3～4次，每次1片。5天後病情控制則減量，每日減5～10mg。總療程為7～10天後停藥，如療程長，為防止感染擴散，應加用抗生素。對嚴重白塞綜合征，可住院後給予氫化可的松100mg或地塞米松5mg和四環素1g加入5%～10%葡萄糖液中，靜脈滴注，病情好轉後逐步減量。對有胃潰瘍、糖尿病、活動期肺結核的患者應禁用或慎用。
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