最近，醫學界經過臨床及免疫研究，已確定其病原為病毒感染。此類病毒屬於原發性病毒，人類感染後即存在體內，藏在表皮下的血管中，並在細胞核中繁殖。當身體免疫系
統異常時，如感冒等，就會激活潛伏在體內的病毒，這些病毒會特別活躍，潰瘍也會明顯加重。
口腔潰瘍還往往成為一種因生活形態導致的“文明病”。根據臨床觀察，口腔潰瘍患者有許多是在過度疲勞後發病的。生活緊張、精神壓力大導致此病越來越多。此外，口腔潰瘍也被認為與遺傳、激素等因素有關，如女性月經前口腔潰瘍會加重，更年期婦女中病例增多，但懷孕期婦女則發病率較低，這些現象都顯示潰瘍的發生受激素變化影響。
口腔潰瘍多數發生在20~50歲之間，發病時多伴有便秘、口臭等現象。中醫認為，要改善復發性口腔潰瘍應注意排便通暢、睡眠充足。同時由於口腔潰瘍也可能是因缺乏維生素B2引起，可多吃蔬菜和小麥胚芽，並補充維生素B2和微量元素鋅。
