復發性口腔潰瘍首先與免疫有著很密切的關系。有的患者表現為免疫缺陷，有的患者則表現為自身免疫反應，也就是由於各種因素，使人體正常的免疫系統，對自身組織抗原，產生免疫反映，而引起組織的破壞而發病。其次是與遺傳有關系。
在臨床中，復發性口腔潰瘍的發病，有明顯的家族遺傳傾向，我們常常看到，父母一方或多方若患有復發性口腔潰瘍，那麼，他們的子女就比一般人更容易患病。
另外，復發性口腔潰瘍的發作，常常還與一些疾病或症狀有關，比如消化系統疾病胃潰瘍，十二指腸潰瘍，慢性或遷延性肝炎，結腸炎等，另外貧血，偏食，消化不良，腹瀉，發熱，睡眠不足，過度疲勞，精神緊張，工作壓力大、月經周期的改變等等。隨著一種或多種因素的活躍、交替、重疊就出現機體免疫力下降，免疫功能紊亂，也就造成了復發性口腔潰瘍的頻繁發作。
口腔潰瘍的常見病因主要有以下幾方面：
1、內分泌變化：有些女性患者往往在月經期發生，可能與體內雌激素量下降有關。
2、精神因素：有的患者在精神緊張、情緒波動、睡眠狀況不佳的情況下發病，可能與植物神經功能失調有關。
3、消化系統疾病及功能紊亂：如腹脹、腹瀉或便秘等情況。
4、遺傳因素也是導致口腔潰瘍的原因之一。如父母雙方均患有復發性口腔潰瘍時，其子女約有80—90%患病，若雙親之一患此病時，其子女約有50—60%患病。
5、其他因素：如缺乏微量元素鋅、鐵、葉酸、維生素B12等，可降低免疫功能，增加復發性口腔潰瘍發病的可能性。
在青壯年時期，很多的口瘡的觸發，都是起因於一次或者若干次的進食過程中，牙齒對口腔粘膜內壁或者舌表面上皮組織和結締組織的錯誤咀嚼傷害，由於口腔中的細菌很多，細菌進入傷口位置暴露的結締組織發生復雜的生物作用和化學作用而形成潰瘍創面，從而形成口瘡。因此要避免不合嘴形的假牙或牙箍、食物過敏、刷牙用力過度，食物刺傷、牙齒誤咬等，減少這些誘因能從根本上減少口腔潰瘍的發生。
一旦發生感冒，機體不適的時候，則是身體的預警信號，要調整工作的節奏，保持休息，多飲水，避免加班熬夜，飲食清淡，切勿抽煙，喝咖啡。保持口腔濕潤，有利於治療。
如果在試用了某種新牙膏或吃了某種從沒吃過的食物之後患了口腔潰瘍，要考慮為過敏引起的，要立即停用停吃。另外，建議用溫水漱口，然後將少量原汁蜂蜜敷在潰瘍面，多次重復，一般很快會明顯好轉。
口腔潰瘍發病時多伴有便秘、口臭等現象，因此應注意排便通暢。要多吃新鮮水果和蔬菜。還要多飲水。但不要隨便使用通便的藥物，否則容易導致機體虛弱，更加重口腔潰瘍的發生。
