得了口腔潰瘍用藥物治療是必不可少的。口腔含漱藥、外敷藥都有消除炎症、消腫止痛、促進潰瘍愈合的作用。局部用藥時，應先用漱口水清洗口腔，特別是患部，把食物殘渣、唾液等漱去，然後用干淨的棉簽輕拭後再局部用藥，以便藥物直接粘附在潰瘍面上。治療口腔潰瘍效果較好的藥物有珠黃散、三七粉、青吹口散、西瓜霜、珍珠粉等。
另外，膜劑的治療效果也不錯，膜劑是以一種高分子材料為基質，吸附了一種或數種藥物成分，維護時間長的藥物。它能比較牢固地粘附在潰瘍表面，充分發揮消炎、防腐、止痛和促進愈合的作用，如一可貼等。
全身治療可口服維生素C、復合維生素B族和有促進上皮愈合功能的微量元素鋅。但要在醫生指導下使用。
