導致扁平苔藓發生的誘因有很多，如果我們能了解這些誘因，積極避免，能更好的降低扁平苔藓的發生幾率。
微量元素 扁平苔藓患者血清鋅多正常，補鋅治療也未取得明顯效果，故有人認為扁平苔藓不全角化為非本質的繼發性的變化。錳對維護線粒體功能有著重要作用，並與它的形成有關。
系統性疾病因素 扁平苔藓患者多伴有各種不同的全身性疾病或症狀，不少患者發病及病情發展與某些系統疾病存在有關，如糖尿病、高血壓消化道功能紊亂等。
局部刺激因素 不同金屬修復體在口內形成電位差。另外，充填物的刺激等，可引起口腔粘膜苔藓樣改變。有報道銀汞充填體引起苔藓樣病損，少數患者也可能對銅、鋅、銀等產生變態反應。這些可能為遲發性超敏反應（Ⅳ型變態反應）接觸性變態可能為游離汞進入粘膜後成為抗原而引起局部反應。
遺傳因素 有人發現本病有家族史傾向，不少學者進行了家系發病研究，但系譜分析不符合單基因遺傳規律。現多從HLA（人類白細胞抗原）方面進行研究。在家族性扁平苔藓患者所攜帶的HLA型基因，明顯高於非家族性扁平 苔藓的對照組，說明扁平苔藓發病可能與遺傳因素有關。
免疫學因素 目前仍不完全清楚。現多認為扁平苔藓為免疫功能低下，可導致對一種未明病毒易感性，並提出患者存在體液免疫紊亂。
