口腔扁平苔癬是一種皮膚-粘膜聯發疾病。因為發生在皮膚上的損害為有臘光樣光澤的丘疹，叢集為三角形或多邊形，乍一看，很像地上長出的“苔癬”，所以叫“扁平苔癬”;口腔粘膜的表現並不像皮膚那樣如“苔癬”，但因為是同屬一病，故稱為口腔扁平苔癬。
根據臨床表現，粘膜典型病損特征，可以明確診斷。難以確診時，可進行活檢，一般化驗及免疫學檢查對本病無特異價值。鑒別診斷如下
1.白斑 頰咬合線及舌背處扁平苔癬，有時肉眼檢查與白斑難以區別。舌背扁平苔癬病損局部為灰白而透藍色，舌乳頭萎縮，微凹、質地較軟，彈性張力基本正常，平滑有潤澤，有時病損如雲霧狀。在舌背病損中間，部分舌乳頭色灰白呈小斑塊狀微突起。而白斑多為白色或白垩狀斑塊，有裂隙，周緣界限清楚，觸之稍硬粗糙，無自覺不適，病程進展緩慢，變化小。病理上白斑上皮為過度角化，可有異常增生。男性較多見，應注意白斑與扁平苔癬也可同時存在。
2.盤狀紅斑狼瘡 盤狀紅斑狼瘡病損常向皮膚側擴展，致使唇紅粘膜皮膚界限不清。而扁平苔癬病損只在粘膜內擴展，不擴展至皮膚。紅斑狼瘡在組織病理上與扁平苔癬不同，其有膠原纖維透明變性、均質化、水腫、斷裂，血管擴張，血管內可見玻璃樣血栓，棘層萎縮變薄，粘膜表面有時可見角質栓塞等。免疫熒光有助於鑒別診斷。
3.剝脫性龈炎 本病具有非特異性，常是某些疾病的一種表征。如天疱瘡，類天疱瘡、銀屑病、良性淋巴組織增生等，都可在牙龈出現相類似的損害。剝脫性龈炎與發生於牙龈的扁平苔癬有時難以區分。本病牙龈表現為充血發紅水腫光亮，上皮可有剝脫，形成糜爛出血，因而有敏感症狀。而龈扁平苔癬一般缺少敏感症狀，表面光滑，可見細微網紋，並常可在口內其他部位查到扁平苔癬損害。
